Phim Mari Và 3 Chú Chó Nhỏ kể về Yuichi sống cùng người cha già Yuzo, con trai Ryota và con gái Aya tại ngôi làng Yamakoshi. Một ngày, gia đình nhỏ này có thêm một thành viên mới là chú chó Mari. Năm 2004, Mari đã sinh ra 3 chú chó con. Tuy nhiên, hạnh phúc của gia đình nhỏ đầm ấm này không kéo dài được bao lâu. Vào ngày 23/10, một trận động đất cực mạnh đã tàn phá ngôi làng. Ông Yuzo và Aya bị vùi dưới đống đổ nát của ngôi nhà, bị thương nặng và không thể di chuyển được. Ông Yuzo đã cảm nhận được tai nạn này khi nghe Mari sủa ầm ĩ trong đêm
